Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR8

Nsmce3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsmce3Q9CPR8 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Nsmce3Q9CPR8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Nsmce3Q9CPR8 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Nsmce3Q9CPR8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms