Protein–RNA interactions for Protein: Q99NH8

Trem2, Triggering receptor expressed on myeloid cells 2, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem2Q99NH8 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Trem2Q99NH8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trem2Q99NH8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trem2Q99NH8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trem2Q99NH8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms