Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB9

Sf3b1, Splicing factor 3B subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b1Q99NB9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Sf3b1Q99NB9 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sf3b1Q99NB9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Sf3b1Q99NB9 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Sf3b1Q99NB9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms