Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA2

Atoh8, Protein atonal homolog 8, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atoh8Q99NA2 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Atoh8Q99NA2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Atoh8Q99NA2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Atoh8Q99NA2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Atoh8Q99NA2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms