Protein–RNA interactions for Protein: Q99MP3

Calcb, Calcitonin gene-related peptide 2, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CalcbQ99MP3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CalcbQ99MP3 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CalcbQ99MP3 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CalcbQ99MP3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms