Protein–RNA interactions for Protein: Q99MJ6

Pdzd3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd3Q99MJ6 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdzd3Q99MJ6 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Pdzd3Q99MJ6 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Pdzd3Q99MJ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Pdzd3Q99MJ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms