Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME6

Atp1b4, Protein ATP1B4, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1b4Q99ME6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Atp1b4Q99ME6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Atp1b4Q99ME6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Atp1b4Q99ME6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC30.6■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC30.58■■■□□ 2.49
Atp1b4Q99ME6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
Atp1b4Q99ME6 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms