Protein–RNA interactions for Protein: Q99MD6

Txnrd3, Thioredoxin reductase 3, mousemouse

Predictions only

Length 652 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Txnrd3Q99MD6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Txnrd3Q99MD6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Txnrd3Q99MD6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Txnrd3Q99MD6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Txnrd3Q99MD6 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms