Protein–RNA interactions for Protein: Q99LD4

Gps1, COP9 signalosome complex subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gps1Q99LD4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gps1Q99LD4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Gps1Q99LD4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gps1Q99LD4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms