Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pagr1aQ99L02 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pagr1aQ99L02 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pagr1aQ99L02 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pagr1aQ99L02 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms