Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU6

Bombesin receptor-activated protein C6orf89 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99KU6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q99KU6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q99KU6 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q99KU6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q99KU6 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q99KU6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q99KU6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q99KU6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q99KU6 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q99KU6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q99KU6 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q99KU6 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q99KU6 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q99KU6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q99KU6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q99KU6 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q99KU6 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q99KU6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q99KU6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q99KU6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q99KU6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q99KU6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q99KU6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q99KU6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q99KU6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q99KU6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q99KU6 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q99KU6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q99KU6 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q99KU6 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q99KU6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q99KU6 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q99KU6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q99KU6 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q99KU6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q99KU6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q99KU6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q99KU6 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q99KU6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Q99KU6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Q99KU6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q99KU6 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Q99KU6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Q99KU6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Q99KU6 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Q99KU6 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Q99KU6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q99KU6 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q99KU6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Q99KU6 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms