Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rnf34Q99KR6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rnf34Q99KR6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf34Q99KR6 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf34Q99KR6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms