Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Prpf19Q99KP6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Prpf19Q99KP6 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prpf19Q99KP6 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.6 ms