Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Clint1Q99KN9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Clint1Q99KN9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Clint1Q99KN9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 289.1 ms