Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN1

Arrdc1, Arrestin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arrdc1Q99KN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Arrdc1Q99KN1 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Arrdc1Q99KN1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Arrdc1Q99KN1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms