Protein–RNA interactions for Protein: Q99KL7

Rab28, Ras-related protein Rab-28, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab28Q99KL7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rab28Q99KL7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rab28Q99KL7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Rab28Q99KL7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms