Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Nlgn1Q99K10 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Nlgn1Q99K10 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Nlgn1Q99K10 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Nlgn1Q99K10 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms