Protein–RNA interactions for Protein: Q99JI4

Psmd6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd6Q99JI4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd6Q99JI4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Psmd6Q99JI4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmd6Q99JI4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd6Q99JI4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms