Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pacsin3Q99JB8 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Pacsin3Q99JB8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Pacsin3Q99JB8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 130.7 ms