Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ddb2Q99J79 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ddb2Q99J79 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ddb2Q99J79 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Ddb2Q99J79 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms