Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Apobec3Q99J72 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apobec3Q99J72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Apobec3Q99J72 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms