Protein–RNA interactions for Protein: Q99J38

Ttc30a1, Tetratricopeptide repeat protein 30A1, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc30a1Q99J38 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ttc30a1Q99J38 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ttc30a1Q99J38 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ttc30a1Q99J38 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms