Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Sf3b5Q923D4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Sf3b5Q923D4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Sf3b5Q923D4 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms