Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Sf3b3Q921M3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Sf3b3Q921M3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sf3b3Q921M3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sf3b3Q921M3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Sf3b3Q921M3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms