Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

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Length 962 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sh3bp4Q921I6 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Sh3bp4Q921I6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sh3bp4Q921I6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
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