Protein–RNA interactions for Protein: Q920N2

Hlcs, Biotin--protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HlcsQ920N2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HlcsQ920N2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HlcsQ920N2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HlcsQ920N2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
HlcsQ920N2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms