Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR2

Snx18, Sorting nexin-18, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx18Q91ZR2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Snx18Q91ZR2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Snx18Q91ZR2 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx18Q91ZR2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms