Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Basp1Q91XV3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Basp1Q91XV3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Basp1Q91XV3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms