Protein–RNA interactions for Protein: Q91VU0

Fam3c, Protein FAM3C, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam3cQ91VU0 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam3cQ91VU0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam3cQ91VU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Fam3cQ91VU0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms