Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
ApofQ91V80 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApofQ91V80 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ApofQ91V80 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
ApofQ91V80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms