Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC31

Ccdc9, Coiled-coil domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9Q8VC31 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Ccdc9Q8VC31 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ccdc9Q8VC31 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Ccdc9Q8VC31 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ccdc9Q8VC31 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms