Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
BbxQ8VBW5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
BbxQ8VBW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
BbxQ8VBW5 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BbxQ8VBW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms