Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3B7

Brd8, Bromodomain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd8Q8R3B7 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Brd8Q8R3B7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Brd8Q8R3B7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Brd8Q8R3B7 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms