Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ClmpQ8R373 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ClmpQ8R373 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ClmpQ8R373 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms