Protein–RNA interactions for Protein: Q8K5B8

Hoxc12, Homeobox protein Hox-C12, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc12Q8K5B8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Hoxc12Q8K5B8 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxc12Q8K5B8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hoxc12Q8K5B8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hoxc12Q8K5B8 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms