Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MyripQ8K3I4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MyripQ8K3I4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
MyripQ8K3I4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
MyripQ8K3I4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms