Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.28
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.27
Ncapd2Q8K2Z4 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ncapd2Q8K2Z4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Ncapd2Q8K2Z4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms