Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2U2

Alkbh6, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh6Q8K2U2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Alkbh6Q8K2U2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Alkbh6Q8K2U2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Alkbh6Q8K2U2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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