Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2T8

Paf1, RNA polymerase II-associated factor 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paf1Q8K2T8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Paf1Q8K2T8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Paf1Q8K2T8 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Paf1Q8K2T8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Paf1Q8K2T8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms