Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2H2

Otud6b, OTU domain-containing protein 6B, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud6bQ8K2H2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Otud6bQ8K2H2 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Otud6bQ8K2H2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Otud6bQ8K2H2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Otud6bQ8K2H2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.3 ms