Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F3

Depp1, Protein DEPP1, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Depp1Q8K2F3 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Depp1Q8K2F3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Depp1Q8K2F3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Depp1Q8K2F3 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms