Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2C9

Hacd3, Very-long-chain (3R)-3-hydroxyacyl-CoA dehydratase 3, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hacd3Q8K2C9 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Hacd3Q8K2C9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Hacd3Q8K2C9 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hacd3Q8K2C9 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms