Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Abcf3Q8K268 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Abcf3Q8K268 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Abcf3Q8K268 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
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