Protein–RNA interactions for Protein: Q8K212

Pacs1, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 1, mousemouse

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Length 961 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs1Q8K212 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pacs1Q8K212 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Pacs1Q8K212 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pacs1Q8K212 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Pacs1Q8K212 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Pacs1Q8K212 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pacs1Q8K212 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms