Protein–RNA interactions for Protein: Q8K119

Pms1, PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pms1Q8K119 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Pms1Q8K119 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pms1Q8K119 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pms1Q8K119 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143.5 ms