Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Slc47a1Q8K0H1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc47a1Q8K0H1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Slc47a1Q8K0H1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Slc47a1Q8K0H1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Slc47a1Q8K0H1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc47a1Q8K0H1 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms