Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZX6

Clec4a3, C-type lectin domain family 4, member a3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4a3Q8JZX6 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Clec4a3Q8JZX6 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clec4a3Q8JZX6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Clec4a3Q8JZX6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Clec4a3Q8JZX6 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a3Q8JZX6 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a3Q8JZX6 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a3Q8JZX6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clec4a3Q8JZX6 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms