Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ78

Znf628, Zinc finger protein 628, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf628Q8CJ78 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Znf628Q8CJ78 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf628Q8CJ78 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf628Q8CJ78 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf628Q8CJ78 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
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