Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIW5

Twnk, Twinkle protein, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TwnkQ8CIW5 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TwnkQ8CIW5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TwnkQ8CIW5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TwnkQ8CIW5 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms