Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIR4

Trpm6, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 6, mousemouse

Predictions only

Length 2,028 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm6Q8CIR4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trpm6Q8CIR4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trpm6Q8CIR4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trpm6Q8CIR4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trpm6Q8CIR4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
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